数据库有哪些可以查结构式

数据库可以查询结构式的有：PubChem、ChemSpider、Reaxys、SciFinder。这些数据库都可以在化学研究中提供非常有用的信息。例如，PubChem是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的一个公开数据库，它存储了大量的生物活性化合物信息，并且支持通过结构式进行搜索。PubChem还提供了丰富的化合物信息，包括其化学性质、生物活性和相关的文献。此外，PubChem还具备良好的用户界面和强大的搜索功能，使得研究人员在寻找特定化合物时非常方便。

一、PUBCHEM、CHEMSPIDER、REAXYS、SCIFINDER

PubChem是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)创建的一个数据库，包含超过1亿个化学分子和数百万个生物活性测试结果。它支持多种搜索方式，包括通过化学名称、结构式、CAS号等进行搜索。其主要特点是开放免费，可以公开访问并且拥有强大的搜索功能。用户可以使用基于结晶的计算工具，如PubChem Sketcher来绘制并查询化学结构。另外，PubChem还支持通过SMILES和InChI这些线性结构表示法进行搜索，提供了强大的灵活性和拓展性。

ChemSpider由英国皇家化学会(RSC)维护，是一个免费的化学结构数据库，包含超过6000万个分子。除了提供化学结构信息之外，ChemSpider还整合了多个数据库的数据，包括Wikipedia、eMolecules、Sigma-Aldrich等，使其成为一个综合性的化学信息平台。其最大的优势在于多源集成，能够提供非常详尽的化学信息。ChemSpider可以通过名称、CAS号，分子式等方式进行查询，并提供类似分子、子结构、拓扑结构等多种高级搜索功能。

Reaxys是由Elsevier公司推出的一个商业数据库，专注于化学反应和合成路径的研究。Reaxys整合了大量的化学反应信息，包括实验条件、试剂、溶剂、催化剂等，并提供详细的步骤和产物预测。其核心优势在于其反应和合成功能强大，适用于合成化学和药物化学研究。用户可以通过化学结构或文献中的具体反应条件进行搜索，获得精准的实验数据和文献支持。

SciFinder由美国化学会(ACS)的子公司CAS推出，是一个全面的化学信息平台，覆盖化学、物理、有机合成、生物、药物学等多个领域。SciFinder的独特之处在于其引文和专利信息全面，提供科研人员所需的详细背景信息。它允许用户通过结构式、名称、分子式、反应路径等多种方式进行检索，并提供详细的化学性质、文献引用、专利等重要信息。

二、PDB、CSD、ZINC、DRUGBANK

PDB（Protein Data Bank）是一个专门存储蛋白质三维结构的数据库，由它提供的结构信息对于生物化学和分子生物学研究是不可或缺的。用户可以通过蛋白质的名称、序列、结构式等方式进行搜索，获得蛋白质的三维模型和相关的实验数据。PDB的主要优势在于其丰富的蛋白质和核酸结构数据，支持结构比较和对接分析。

CSD（Cambridge Structural Database）是由剑桥晶体数据中心（CCDC）维护的一个化学晶体结构数据库，专注于分子结晶学。它包含了超过一百万个有机和金属有机化合物的结晶学数据。其重点在于提供高精度的晶体结构信息，非常适合研究分子排列、晶体工程等领域。用户可以通过化石学码、分子式、结构片段等方式进行检索。

ZINC数据库提供了商用化合物的免费集合，主要用于虚拟筛选和药物发现。它包含了数百万个可供购买的化合物，同时提供了它们的3D结构、物理化学性质和供应商信息。ZINC的亮点在于其用于药物筛选的数据集和灵活的检索方式，可以通过结构式、名称、供应商和药物特性进行搜索。

DrugBank是一个综合性的药物和药用化合物数据库，包含详细的分子、药理和生化信息。除了化合物的结构和性质，DrugBank还提供药物的靶点、机制、代谢途径以及临床试验信息。DrugBank的优势在于其药物信息的全面性和专业性，为药物研究提供了重要的数据支持。用户可以通过药物名称、结构式、作用机制等方式检索相关信息。

三、KNApSAcK、NCI、METLIN、HMDB

KNApSAcK是一个专注于植物代谢物的数据库，由日本奈良科学技术研究所创建。它包含丰富的植物化学成分信息，如代谢物的结构、性质、分布以及其生物活性。KNApSAcK的特别之处在于详细的植物源化合物信息，适用于天然产物研究和植物化学研究。用户可以通过代谢物的化学结构、植物名称、化合物名称等进行检索。

NCI（National Cancer Institute）的数据库则以癌症研究为主，提供大量抗癌化合物的信息。NCI数据库包含了数万个化合物及其生物活性测试结果，支持通过化学结构、名称、分类等方式查询。其主要特色在于提供专门用于抗癌研究的化合物数据，有助于药物开发和机制研究。

METLIN是一个代谢物数据库，主要用于质谱分析。它由加州大学圣地亚哥分校创建并维护，包含大量已知代谢物的质谱数据。METLIN的强项在于其详尽的质谱数据和代谢途径信息，适用于代谢组学和定量质谱分析。用户可以通过代谢物的结构、质谱图、名称等进行检索。

人类代谢物数据库(Human Metabolome Database, HMDB) 专注于人代谢物信息，它由加拿大阿尔伯塔大学创建，包含详细的人类代谢物信息。包括其结构、浓度、代谢途径、生物样本位置以及相关的生化数据。HMDB的优势在于其专注于人类代谢物数据，为医学研究、疾病诊断和药物开发提供了重要的资源。用户可以通过代谢物的结构式、名称、分子式和生物途径等多种方式进行查询。

四、CSD、PAFAWORKS、CHEMIDPLUS、CHEMINFO

CSD（Cambridge Structural Database）是一个集成的三维结构数据库，主要存储有机化合物和金属有机化合物的晶体结构。其数据在制药、材料科学和学术研究中使用广泛。CSD的特别之处在于其详细的三维晶体结构数据和优化的检索工具，能够帮助研究人员深入研究分子结构和晶体行为。用户可以通过化学名称、分子结构、文献等方式进行检索。

PAFAWorks是一个专业为Toxicology和风险评估提供服务的平台，它主要包括针对有害化学物质的毒性、生物效应和物理化学性质的数据。PAFAWorks主要用于环境健康和安全研究，提供全面的化学品风险评估数据。用户可以通过化学结构、毒性数据、物理化学性质等方式查询化学品信息。

ChemIDplus是由美国国家医学图书馆(NLM)创建的一个化学数据库，包含了超过40万种化学物质的信息。它整合了多种数据源，提供详细的化学结构、物理化学性质和毒性数据。ChemIDplus的优势在于其广泛的数据覆盖面和多源整合，适用于多学科交叉研究。用户可以通过化学名称、结构式、CAS号等进行检索。

ChemInfo是一个专注于化学安全数据的数据库，提供化学品的安全使用信息，包括物理化学性质、毒性数据、急性反应和安全处理方法。ChemInfo的亮点在于其专注于提供综合的化学品安全信息，适用于化工生产和安全管理。用户可以通过化学品名称、结构式、危险性质等方式检索相关安全数据。

五、CHEMspider、EMOLBASE、TOXNET、CHEMSPACE

ChemSpider由英国皇家化学会(RSC)维护，提供一个集成的化学结构数据库，包含6000多万种分子的详细信息。其集成了多个来源的数据，为科研人员提供了一个综合的化学信息平台。ChemSpider的优势在于其数据整合和广泛的化学信息覆盖，可以通过化学名称、结构式、物理化学性质等多种方式进行查询。

eMolecules是一个商业化数据库，提供化学品供应信息和结构数据，包含数百万个分子的详细信息。eMolecules的特点在于其商用化学品的供应链数据支持，适用于化学合成和商业采购。用户可以通过化合物名称、结构式、供应商信息等多种方式搜索相关数据。

TOXNET是由美国国家医学图书馆(NLM)创建的一个综合性毒理学数据库，包含了广泛的毒性数据、环境健康信息和指令化学品数据。TOXNET的优势在于其全面的毒理学信息和环境健康数据，适用于风险评估和环境安全研究。用户可以通过化学名称、结构式、毒性数据等方式进行检索。

ChemSpace是一个提供化合物购买和虚拟库的数据库，支持虚拟筛选和药物设计，包含数百万种分子的详细信息。ChemSpace的亮点在于其用于药物研发的虚拟合成和筛选功能。用户可以通过化学结构、性质、供应商信息等多种方式进行搜索，获取相关化学品的详细信息。

相关问答FAQs：

1. 什么是结构式查询？

结构式查询是一种特殊的数据库查询方法，它允许用户根据分子结构的特征来搜索数据库中的化合物。用户可以利用分子的结构、键合、原子类型等信息来进行查询，从而找到符合特定结构要求的化合物数据。

2. 有哪些数据库可以进行结构式查询？

• PubChem：PubChem是一个免费公开的化学数据库，提供了上百万种化合物的信息，用户可以通过结构式查询来检索所需化合物信息，并查看其性质、活性等数据。

• ChemSpider：ChemSpider是由皇家化学学会运营的化学信息数据库，汇集了全球各种来源的化学信息资源。用户可以通过输入分子的结构式或名称来查找相关化合物信息。

• ChEMBL：ChEMBL是一个生物活性分子数据库，包含了丰富的生物活性数据，用户可以通过结构式查询来检索化合物的生物活性信息，如药效、靶点等数据。

3. 结构式查询在化学领域中的应用有哪些？

结构式查询在化学领域中具有广泛的应用，比如药物设计、环境科学、毒理学研究等方面：

• 药物设计：通过结构式查询，研究人员可以搜索现有的化合物数据库，找到具有特定结构特征的化合物，从而进行药物筛选和设计。

• 环境科学：结构式查询可以帮助研究人员识别环境中存在的化学物质，并了解其在自然界中的行为和影响。

• 毒理学研究：通过对毒性数据和分子结构的关联分析，可以帮助科学家更好地理解化合物的毒性机制，评估潜在的毒性风险。